El UNIX al estar estructurado en árbol se forma una jerarquía de directorios que para un sistema seria:
/ Raíz del sistema de archivo.
/bin Programas esenciales en forma ejecutable
/dev Archivos de dispositivos.
/etc Sistemas diversos.
/etc/motd Mensaje del dia al inicio de sesión.
/etc/passwd Archivos de contraseñas.
/lib Bibliotecas esenciales, etc.
/tmp Archivos temporales, desaparecen cuando se reanuda el sistema.
/unix Forma ejecutable del sistema operativo.
/usr Sistemas de archivos del usuario.
/usr/adm Administración del sistema, información contable, etc.
/usr/bin Binarios del usuario.
/usr/dict Diccionario ( words ) y soporte de spell ( 1 ) etc.
Los directorios se crean mediante la llamada al sistema mkdir y se pueden eliminar mediante rmdir. El directorio actual se cambia mediante chdir.
Los directorios son la base del sistema jerárquico de archivos de Unix. Son grupos de archivos que sirven para clasificarlos y organizarlos de acuerdo a las necesidades de los usuarios. Un directorio puede contener otros directorios y archivos, y así sucesivamente. En teoría, no existe limitación del número de archivos y directorios que se puedan crear en un directorio, con excepción del tamaño del dispositivo donde se almacena. El sistema de directorios y archivos se puede graficar en lo que se conoce como estructura de árbol.